Die Direktorin sowie die stellvertretenden Direktor*innen von SCRIPTS vertreten den gesamten Exzellenzcluster und leiten die Mittelvergabe sowie das Budgetmanagement. Neben ihren eigenen wissenschaftlichen Beiträgen zur SCRIPTS-Forschung und zu Kooperationen sind die Direktorin sowie die stellvertretenden Direktor:innen dafür verantwortlich, die verschiedenen Verwaltungs- und Forschungsgremien einzuberufen, die zentrale Leitung zu überwachen und den Vorstand („Executive Board“) zu leiten.